Het eiland Marathonissi is een klein eilandje ten zuiden van het grotere Zakynthos. Het ligt in het Nationale Marine Park van Zakynthos in de baai van Laganas, dat hier is gevestigd met de bedoeling om de zeeschildpadden te beschermen. Het zandstrand van het eiland Marathonissi wordt door de schildpadden gebruikt om hun eieren te leggen. Het eiland heeft twee stranden: een strand met fijn wit zand en een strand met kiezeltjes. Ook zeehonden bezoeken het eiland.
Marathonissi is een onbewoond en groen eiland dat is bedekt met pijnbomen, olijfbomen en eiken. Vanaf het dorp Keri op Zakynthos is het mogelijk om het eiland bezoeken met een dagexcursie, maar het is ook mogelijk om tegen een niet al te hoog bedrag zelf een motorbootje te huren en zo het eilandje te gaan bekijken. Er zijn op Marathonissi geen faciliteiten (dus ook geen taverne). Het wordt dus aangeraden om zelf water en iets te eten mee te nemen als je naar het eiland wilt gaan. Interessant zijn ook de zeegrotten van Marathonissi. Het is een geliefde plek voor mensen om te snorkelen en de zeeschilpadden te bekijken die rond het eiland zwemmen.